QDD version 3.1: a user-friendly computer program for microsatellite selection and primer design revisited: experimental validation of variables determining genotyping success rate

Emese Meglécz; Nicolas Pech; André Gilles; Vincent Dubut; Pascal Hingamp; Aurélie Trilles; Rémi Grenier; Jean-François Martin

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QDD version 3.1: a user-friendly computer program for microsatellite selection and primer design revisited: experimental validation of variables determining genotyping success rate

Emese Meglécz ¹ Nicolas Pech ¹ André Gilles ¹ Vincent Dubut ¹ Pascal Hingamp Aurélie Trilles Rémi Grenier Jean-François Martin ²

1 IMBE - Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale

2 UMR CBGP - Centre de Biologie pour la Gestion des Populations

Emese Meglécz ¹ AuthorId : 627003

Author IdHAL : emese-meglecz ORCID : https://orcid.org/0000-0001-7547-4858

Nicolas Pech ¹ AuthorId : 394551
Author

André Gilles ¹ AuthorId : 447931
Author

Vincent Dubut ¹ AuthorId : 447933

Author IdHAL : vincent-dubut ORCID : https://orcid.org/0000-0002-5619-6909

Pascal Hingamp AuthorId : 143370

Author IdHAL : pascal-hingamp ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7463-2444

Aurélie Trilles AuthorId : 11645249
Author

Rémi Grenier AuthorId : 627002
Author

Jean-François Martin ² AuthorId : 1630235

Author Employer institution : Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier IdHAL : jean-francois-martin ORCID : https://orcid.org/0000-0001-9176-4476

1 IMBE - Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (Aix Marseille Université, Campus Etoile, Faculté St-Jérôme case 421 Av. . escadrille Normandie-Niemen 13397 MARSEILLE CEDEX 20 - France) StructId : 188653

CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7263 (France) StructId : 441569
Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237 : UMR7263 (France) StructId : 302715
AMU - Aix Marseille Université : UMR7263 (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France) StructId : 198056
AU - Université d'Avignon et des Pays du Vaucluse : UMR7263 (74 rue Louis Pasteur - 84 029 Avignon cedex 1 - France) StructId : 195507

2 UMR CBGP - Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (755 avenue du Campus Agropolis, 34988 Montferrier sur Lez - France) StructId : 12765

CIRAD - Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement : UMR 55 (Siège 42, rue Scheffer 75116 Paris - France) StructId : 11574
Montpellier SupAgro - Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques : UMR 1062 (2, place Pierre Viala - 34060 Montpellier Cedex 02 - France) StructId : 92699
INRA Montpellier - Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] : UMR 1062 (2 Place Viala, 34060 Montpellier cedex 1 - France) StructId : 135709
UM - Université de Montpellier : UMR 1062 (163 rue Auguste Broussonnet - 34090 Montpellier - France) StructId : 410122
IRD [France-Sud] - Institut de Recherche pour le Développement : UMR 1062 (911 avenue Agropolis, BP 64501 34394 Montpellier cedex 5 - France) StructId : 451860
Montpellier SupAgro - Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (2, place Viala 34060 Montpellier Cédex 2 - France) StructId : 474617

Document type :

Journal articles

Domain :

Computer Science [cs] / Bioinformatics [q-bio.QM]

Complete list of metadatas

https://hal-montpellier-supagro.archives-ouvertes.fr/hal-02356473
Contributor : Jean-Francois Martin <>
Submitted on : Friday, November 8, 2019 - 5:35:49 PM
Last modification on : Sunday, November 10, 2019 - 1:07:29 AM

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HAL Id : hal-02356473, version 1
DOI : 10.1111/1755-0998.12271

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Emese Meglécz, Nicolas Pech, André Gilles, Vincent Dubut, Pascal Hingamp, et al.. QDD version 3.1: a user-friendly computer program for microsatellite selection and primer design revisited: experimental validation of variables determining genotyping success rate. Molecular Ecology Resources, Wiley/Blackwell, 2014, 14 (6), pp.1302-1313. ⟨10.1111/1755-0998.12271⟩. ⟨hal-02356473⟩

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